当时，镇江博物馆考古人员立即对该区域进行了抢救性考古发掘，先后发现宋元粮仓、元代石拱桥等遗址。这些遗址前临宋元时期的运河，后枕长江，规模宏大，布局规整。根据考古发现与文献对比考证，这处粮仓很可能就是转般仓和大军仓遗迹，是宋、元、清三个朝代的遗迹。这处遗址的发现，丰富了古代镇江作为转运港口的历史，对于大运河申遗和大运河文化遗产保护具有特别意义。

这个发现，也作为江苏省两个候选项目入围了“2009年全国十大考古新发现”初评名单。

对此，国家、省两级文物部门高度重视。

2010年1月8日，国家文物局向江苏省文物局发来《关于镇江市运河相关遗迹保护的函》，提出保护要求。

1月23日，国家文物局文物保护与考古司司长关强率领国家文物局考古专家组有关专家赴现场视察，进一步提出了大运河仓储遗迹保护意见。

2月3日，江苏省文物局召开专题会议，要求镇江市文物考古部门开展全面彻底的考古勘探发掘工作，同时明确了要将粮仓、桥、河道、驿站、衙署机构等建筑遗迹整体进行保护，与未来小区结合起来进行规划。按照要求，镇江市文化局将根据考古工作的结果尽快制订遗迹保护方案，待省级文物考古专家论证通过后实施。

然而，一道道保护令之下，13座宋元粮仓遗址，还是在挖掘机不停施工中，遭到巨大毁坏。考古“新发现”尚未与公众见面，已经面临着消逝的可能。