松本城的前身是深志城。室町时代初期，足利尊氏的家臣小笠原贞宗任信浓守护时，建筑了此城。松本城为典型的平城。本丸、二之丸、三之丸城郭大致上呈方形。天守设置在本丸西南部，並以缺少北部的凹型二之丸加以包围，外面再以四方形的三之丸整个围住。
