此后韩朝之间的体育交流一度被搁置,而以韩朝2000年6月举行的首脑会谈为契机,双方之间的体育交流再度蠢蠢欲动。在韩朝首脑会谈之前的1999年8月和9月,双方分别举行韩朝劳动者足球大赛和韩朝统一篮球大赛。第一次韩朝首脑会谈结束后,时任大韩奥林匹克委员会委员长金云龙和时任朝鲜奥林匹克委员会副委员长张雄就韩朝代表团同时入场达成了一致。据此2000年9月韩朝代表团拿着“韩半岛旗”同时步入悉尼奥运会开幕式,感动全世界的观众。从此以后,韩朝在包括2004年雅典奥运会、2006年都灵冬奥会、2007年长春亚洲冬季运动会等共9项国际体育活动中同时入场。尤其是在韩国举办2002年釜山亚运会、2003年大邱世界大学生运动会时,朝鲜派遣大规模啦啦队,韩朝之间的体育交流达到了顶峰。
但是前总统李明博执政以来,韩朝之间的体育交流被全面中断。今年朴槿惠政府成立以来,韩朝关系因朝鲜进行第三次核试验等因素陷入僵局,韩朝体育交流也未出现重启的兆头。但是最近朝鲜寻求重启六方会谈的机会,从上月开始韩朝当局之间形成为解决开城工业园区问题而进行对话的气氛,韩朝体育交流也迎来了新局面。